基因水平轉(zhuǎn)移研究
不依賴于培養(yǎng),實現(xiàn)基因水平轉(zhuǎn)移的可視化檢測
基因水平轉(zhuǎn)移(HGT)是指微生物物種內(nèi)部和物種間進(jìn)行基因交換的現(xiàn)象,在抗生素耐藥性的快速傳播中起著重要作用,篩選發(fā)生水平轉(zhuǎn)移的陽性受體是環(huán)境微生物研究的難點之一。
應(yīng)用PRECI SCS可視化單細(xì)胞分選儀,結(jié)合熒光標(biāo)簽/穩(wěn)定同位素標(biāo)記,可實現(xiàn)轉(zhuǎn)移了目標(biāo)基因的陽性受體的快速檢出。并且,可進(jìn)一步實現(xiàn)陽性受體的精準(zhǔn)分離以及下游的培養(yǎng)或測序研究,追蹤耐藥基因的傳播過程。
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不依賴培養(yǎng)
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高效率追蹤
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可視化檢測
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單細(xì)胞精度
熒光識別結(jié)合LIFT分選,基因水平轉(zhuǎn)移研究可視化研究方案
傳統(tǒng)基因水平轉(zhuǎn)移的驗證依賴于轉(zhuǎn)移后體系的培養(yǎng)篩選,該過程通常橫跨2-3天,并且無法用于探究環(huán)境中未培養(yǎng)菌的基因水平轉(zhuǎn)移。
建立由攜帶熒光蛋白與耐藥基因的供體與微生物群落受體組成的體外接合系統(tǒng),采用具有熒光成像模塊配置的PRECI SCS可視化單細(xì)胞分選儀,識別并分離具有特定熒光信號的陽性受體(包括可培養(yǎng)與未培養(yǎng)微生物),極大縮短實驗周期,為基因水平轉(zhuǎn)移領(lǐng)域的探究提供了有力的工具。
rD2O-Raman-LIFT,縮短陽性受體篩選周期
利用反向D2O-單細(xì)胞拉曼檢測技術(shù)(Raman-rD2O),PRECI SCS-R300拉曼單細(xì)胞分選儀能夠可靠且快速地追蹤耐藥基因的轉(zhuǎn)移和擴(kuò)散。
該方法具有很高的靈敏度,能夠在大量受體菌中識別出少量的抗性轉(zhuǎn)化子,可用于破解影響抗性質(zhì)粒轉(zhuǎn)移以及持續(xù)的因素,并通過與基因型的關(guān)聯(lián)研究,更好地理解耐藥基因的傳播風(fēng)險。
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《The ISME Journal》丨環(huán)境耐藥基因水平轉(zhuǎn)移機(jī)制最新研究成果2024.04.10 -
《Analytical Chemistry》 | HOOKE單細(xì)胞分選儀助力耐藥基因水平基因轉(zhuǎn)移研究2020.12.16
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