應(yīng)用長(zhǎng)光辰英自主研發(fā)的多模態(tài)、跨尺度微生物篩選平臺(tái),突破未培養(yǎng)微生物研究瓶頸,有效解決目標(biāo)菌豐度低、篩選效率低、樣品雜質(zhì)干擾等問(wèn)題,實(shí)現(xiàn)功能菌的靶向、高效篩選培養(yǎng)。
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未培養(yǎng)微生物
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單細(xì)胞技術(shù)
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原位表征
微生物資源開(kāi)發(fā)新思路
針對(duì)可培養(yǎng)微生物,在培養(yǎng)皿原位基于菌落微觀圖像表型信息,實(shí)現(xiàn)準(zhǔn)確、客觀、自動(dòng)化的菌株“去重復(fù)”,可以極大提高篩菌效率。
針對(duì)尚無(wú)法在平皿上形成菌落的未培養(yǎng)微生物,采用單細(xì)胞表型識(shí)別與分選技術(shù),繞過(guò)培養(yǎng)階段,實(shí)現(xiàn)對(duì)微生物細(xì)胞在原位群落中特性的逐一表征。
多模態(tài)、跨尺度的微生物篩選工具平臺(tái)
自主開(kāi)發(fā)多模態(tài)、跨尺度微生物篩選平臺(tái),在單細(xì)胞、單克隆兩個(gè)維度上實(shí)現(xiàn)基于形態(tài)、熒光、拉曼光譜的多模態(tài)微生物個(gè)體表征,及自動(dòng)化單細(xì)胞/單克隆篩選,解決微生物篩選過(guò)程中隨機(jī)性強(qiáng)、重復(fù)率高、鑒定成本高、篩選周期長(zhǎng)、低豐度及未培養(yǎng)菌無(wú)法獲得等問(wèn)題。為微生物資源庫(kù)構(gòu)建、功能菌株篩選提供前沿工具平臺(tái)。
微生物篩選全流程解決方案
應(yīng)用多模態(tài)、跨尺度微生物篩選平臺(tái),建立了從樣品前處理到單細(xì)胞表型檢測(cè)-可視化分選/菌落原位去重篩選,以及單細(xì)胞測(cè)序、培養(yǎng)等全流程解決方案。
在樣品前處理階段,可應(yīng)用磁性納米顆粒等技術(shù)實(shí)現(xiàn)低豐度菌株的有效富集。隨后使用RAcolony 高通量菌落智能篩選系統(tǒng),高效獲得更高覆蓋率的菌株;同時(shí)針對(duì)樣品中的未培養(yǎng)微生物,可根據(jù)情況進(jìn)行熒光原位雜交(FISH)、穩(wěn)定同位素(SIP)等標(biāo)記,并分別使用S3000 超快三維熒光成像系統(tǒng)、P300 共聚焦拉曼光譜儀、PRECI SCS-R300 拉曼單細(xì)胞分選儀或Scatcher R 單細(xì)胞拉曼光鑷操縱與分選儀進(jìn)行形態(tài)、熒光或拉曼光譜的檢測(cè)。識(shí)別到的目標(biāo)菌,應(yīng)用PRECI SCS 可視化單細(xì)胞分選儀或Scatcher 單細(xì)胞顯微光鑷操縱與分選儀將其精準(zhǔn)地分離到裂解液、培養(yǎng)基或基質(zhì)液中,從而實(shí)現(xiàn)單細(xì)胞的多組學(xué)研究。
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